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生物試劑研究人胚胎早期器官形成過程的轉錄組研究新進展
更新時間:2014-09-25   點擊次數:1161次

生物試劑研究人胚胎早期器官形成過程的轉錄組研究新進展

    著床后人胚胎發育涵蓋了胚胎早期器官形成zui關鍵時期,即從Carnegie Stage 9(胚胎發育第20天,E20)到Carnegie Stage 14(胚胎發育第32天,E32)。從發育形態變化角度,各個器官經歷了從無到有的奇妙過程;從發育進化角度,這個奇妙過程高度保守;從發育潛能角度,干性潛能與分化潛能既定時空程序協調性變化。這些背后的分子基礎是遺傳信息表達精密調控的基因相互作用網絡。然而,相比模式生物與體外細胞模型研究,由于受限于人胚胎研究標本以及倫理上的限制,關于人胚胎發育的分子機制知之甚少。

    楊穎博士和方海博士等在金穎和張濟導師的指導下,與新華醫院婦產科合作,利用臨床藥物流產胚胎,應用基因芯片對該早期器官胚胎發育6個連續階段進行基因表達變化譜刻畫。通過數據深層次挖掘并整合功能、轉錄調控、表型及疾病相關的數據庫,他們發現整個胚胎形態變化受基因表達譜變化所驅使,主要包括兩組基因:呈現逐漸下調變化趨勢的基因負責早期器官起始,而逐漸上調變化的基因主要參與器官原基形成。同小鼠發育表達譜以及人胚胎干細胞各種組學數據進行比較分析,進一步發現干性相關基因呈逐漸降低的趨勢,而分化相關基因呈現兩種表達模式。 在此基礎上,整合蛋白質相互作用信息,挖掘人胚胎早期器官過程中相互作用網絡(hORGNet),由兩個細化的與干性相關的模塊(hStemModule)和與分化相關的模塊(hDiffModule)模塊組成,分別表征干性潛能狀態變化情況與分化狀態。進一步通過小鼠表型富集分析,hStemModule可能與胚胎早期致死相關,而hDiffModule則可能多的是與出生后致死相關。這一研究建立了上*的人早期器官形成期基因表達的譜式,為探索人類發育早期的分子調控和人多能干細胞體外的定向誘導分化提供的寶貴的信息。

340-90-9    [4-(2-naphthyl)phenyl]boronic acid    4-chloropyridine    
340-05-6    918799-14-1    626-64-2    
340-05-6    3-溴-4,5,6-*氧基-2-甲基苯...    4-羥基吡啶    
339-59-3    3-bromo-4,5,6-trimethoxy-2-methylphenol    4-Pyridinol    
339-59-3    918879-58-0    626-67-5    
338-98-7    H2ATSM/A    N-甲基哌啶    
338-98-7    H2ATSM/A    N-Methylpiperidine    
338-95-4    919346-89-7    626-72-2    
338-95-4    5-溴異二氫吲哚鹽酸鹽    L-高胱氨酸    
338-84-1    5-Bromo-2,3-dihydro-1H-Isoindole Hydrochloride    4,4'-dithiobis[2-aminobutyric] acid    
338-84-1    919347-69-6    626-82-4    
338-83-0    5-醛基吡啶-3-硼酸    己酸丁酯    
338-83-0    5-formylpyridin-3-ylboronic acid    butyl caproate    
338-76-1    919475-15-3    626-86-8    
338-76-1    2-[4-(芐氧基)苯基]-N,N-二甲...    己二酸單乙酯    
338-69-2    Benzeneacetamide, N,N-dimethyl-4-(phenylmethoxy)-    Adipic acid monoethyl ester    
338-69-2    920979-04-0    626-87-9    
338-38-5    2-氟-3-碘-6-甲基吡啶    1,4-二溴戊烷    
338-38-5    2-fluoro-3-iodo-6-methylpyridine    1,4-Dibromopentane    
336-59-4    921205-03-0    626-88-0    
336-59-4    3,3'-[5'-[3-(3-吡啶基)苯基][...    1-溴-4-甲基戊烷    
335-76-2    3,3'-[5'-[3-(3-Pyridinyl)phenyl][1,1':3',1''-terphenyl]-3,3'...    1-bromo-4-methylpentane    
335-76-2    921630-14-0    626-89-1    
335-67-1    2-溴-5-氯吡啶-4-甲醛    4-甲基-1-戊醇    
335-67-1    2-Bromo-5-chloropyridine-4-carboxaldehyde    4-Methyl-1-pentanol    
335-64-8    923009-50-1    626-93-7    
335-64-8    1-氧代-2,7-二氮雜螺[4.5]癸烷...    2-己醇    
335-57-9    tert-butyl 2-ethyl-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.5]decane-7-carboxy...    2-Hexanol    
335-57-9    923009-50-1    626-97-1    
335-56-8    2,7-二氮雜螺[4.5]癸烷-1-酮    戊酰胺    
335-56-8    tert-butyl 1-oxo-2,7-diazaspiro[4.5]decane-7-carboxylate    valeramide    
334-88-3    923032-59-1    627-00-9    
334-88-3    1-烯丙基環丙磺酰氯    4-氯丁酸    
334-64-5    1-Allylcyclopropane-1-sulfonyl chloride    4-chlorobutyric acid    
334-64-5    923036-30-0    627-03-2    
334-63-4    N-甲基-N-((3R,4R)-4-甲基-1-...    乙氧基乙酸

 

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